Chartreuserordenen havde eksisteret i mere end 500 år, da munkene i 1605 i et chartreuserkloster i Vauvert, en lille forstad til Paris, modtog en gave fra hertug François Hannibal d'Estrées: et gammelt manuskript om en "Eliksir" kaldet "Elixir of Longue Vie". Dette manuskript var sandsynligvis værket af en alkymist fra det 16. århundrede med stor viden om urter og med evnen til at samle, infusere og macerere de 130 af dem for at danne en perfekt afbalanceret tonic. Opskriften i manuskriptet var så kompleks, at kun dele blev forstået og brugt i Vauvert. I begyndelsen af det 18. århundrede blev manuskriptet sendt til Ordens moderhus, La Grande Chartreuse, i bjergene nær Grenoble. Klostrets apoteker, broder Jérôme Maubec, lykkedes det til sidst at opklare mysteriet og i 1737 skrev han den praktiske formel for fremstilling af Eliksiren i 1764. I 1903 nationaliserede den franske regering Chartreuse-destilleriet, og munkene blev fordrevet. Ved konkursen i 1929 genvandt munkene ejerskabet af mærket Chartreuse. De vendte tilbage til deres destilleri, bygget i 1860 i Fourvoirie, ikke langt fra klosteret, og genoptog produktionen af de ægte Chartreuse-likører. I 1935 blev Fourvoirie næsten ødelagt af et jordskred; produktionen blev flyttet til Voiron, hvor den stadig er i dag.
Udvælgelsen, knusningen og blandingen af de hemmelige urter, planter og andre medicinske planter, der anvendes i produktionen af likørerne, udføres i klosteret af to munke. Når ingredienserne er blandet, transporteres de til Voiron, hvor de først lægges i blød i omhyggeligt udvalgt alkohol og derefter destilleres. Endelig lagres disse likører i flere år i enorme egetræsfade og placeres i lagringskælderen, som har verdens længste modningstid.